Er zijn acht fases. Het gaat om de schommeling van het centrum van lagere druk (convectiviteit) tussen de Indische en de Stille Oceaan. Simple gezegd begin je met verhoogde convectie in de indische oceaan, die dan oostwaarts beweegt. Zo doorloopt de MJO 8 fases. De intensiteit van de convectie kan in de loop van de fases versterken of verzwakken. EL nino/La nina hebben hierop ook invloed. Een koude Stille oceaan zal vermoedelijk de convectie afremmen. Bij de oostwaartse shift van het gebied zijn er koppelingen met bijvoorbeeld de luchtdruk boven de poolkap en blokkades in de centrale Atlantische Oceaan of scandinavië. Bij bepaalde fases verhoogt de frequentie van blokkades, bij anderen verlaagt die. Het zijn dus zeker geen 1 op 1 connecties.